Akreditasi internasional dipandang mempunyai peran yang sangat penting dalam upaya meningkatkan reputasi UGM di mata dunia. Selain itu, akreditasi internasional juga merupakan sarana untuk meningkatkan mutu pembelajaran internal, karena bukan saja dunia dapat melihat UGM sejajar dengan universitas kelas dunia lainnya, namun standar yang digunakan dalam akreditasi internasional hampir pasti merupakan standar yang tinggi sehingga keberhasilan perolehan akreditasi internasional akan menunjukkan mutu yang sesuai dengan standar dunia.
Dalam rangka mewujudkan komitmen memberikan dukungan pencapaian akreditasi internasional maupun sertifikasi internasional, UGM melalui KJM menyelenggarakan beberapa program kerja yang memfasilitasi persiapan akreditasi internasional secara sistematik kepada fakultas, program studi maupun sekolah di lingkungan UGM. Salah satu program kerja yang telah dilaksanakan di tahun 2016 adalah memberikan hibah persiapan akreditasi internasional yang berfokus pada kegiatan penyusunan dokumen Evaluasi Diri Akreditasi Internasional Program Studi sesuai dengan format ASIIN dan ABET. Selain itu juga memberikan hibah persiapan sertifikasi AUN-QA yang berfokus pada kegiatan penyusunan dokumen Asean University Network-Self Assessment Report (AUN-SAR).
Saat ini ada beberapa program studi di UGM yang sudah mendapat pengakuan akreditasi internasional, misalnya Fakultas Ekonomika dan Bisnis yang telah memperoleh akreditasi bergengsi AACSB untuk 9 program studi akuntansi dan bisnis. Demikian juga program studi Kimia dari Fakultas MIPA telah memperoleh pengakuan dari Royal Socieity of Chemistry (RSC) dan program studi Teknik Kimia telah memperoleh pengakuan dari IcheMe. Selain itu, program studi IKM dari Fakultas Kedokteran telah mendapat pengakuan akreditasi internasional. Selain itu, UGM melalui KJM dengan kegiatannya berupa pemberian hibah akreditasi internasional 2016, tengah mengupayakan 11 program studi di Fakultas Teknik, Teknologi Pertanian, MIPA, dan Geografi untuk mendapatkan akreditasi internasional dari the Accreditation Board for Engineering and Technology (ABET) yang berpusat di Amerika Serikat dan Accreditation Agency for Degree Programmes in Engineering, Informatics, the Natural Sciences and Mathematics (ASIIN) yang berpusat di Jerman. Diharapkan tahun 2017, beberapa program studi tersebut akan mendapat visitasi dari ABET dan ASIIN.
Sedangkan untuk program internasionalisasi program studi melalui hibah AUN-SAR, pada tahun 2016 kegiatan yang dilaksanakan melalui KJM adalah memfasilitasi program sertifikasi AUN-QA untuk enam program studi, yaitu Arsitektur, Geofisika, Geografi dan Ilmu Lingkungan, Sosial Ekonomi Pertanian / Agribisnis, Ilmu Filsafat, serta Politik dan Pemerintahan. Hingga visitasi sertifikasi terkahir pada Agustus 2016, 32 program studi di level S1 UGM sudah mendapat sertifikasi AUN-QA dan beberapa program studi maupun unit kerja di UGM juga sudah ada yang mendapatkan sertifikat ISO 9001:2008/SGS.